1、殺菌劑的選擇根據不同的水質、細菌的種類，特別是pH值。當pH值較高時，不宜用氯氣等氧化性殺菌劑，而季銨鹽類殺菌劑pH值越高越好。當水中含有Fe2＋和H2S時，不宜使用氧化性殺菌劑，否則不僅會增加氧化性殺菌劑用量，而且影響污水處理的水質。與其它水處理劑配伍，不能發生反應相互抵消其效果。具有良好的溶解性，加入后不影響水質加入后，不能增加水中的膠體顆粒數，能均勻溶解水中，且清澈透明。同一污水處理系統應間隔選用不同種類的殺菌劑，以免細菌產生抗藥性 低毒，易降解，無環境污染。